正常的施量是不會傷植物的根部的。但是，生物有機肥施多了會燒根。生物有機肥已經發酵了很長時間了，其中的無機鹽類含量已經不低了，所以施肥多了，肯定會使得根部離子濃度過高，出現燒根現象。但是不會出現燒死植物的現象，其因有二： 
   一、生物有機肥肥效穩定溫和，對土壤的溶液度改變相對緩慢不會造成植物脫水死亡；
   二、生物有機肥經過高溫腐熟發酵處理，施于土壤不像未經處理的農家肥會作嘔發酵，腐爛植物的根須。 
   萬一施量多了，那該怎么處理呢？
   1.應加強通風，避免氣害蔓延生物有機肥在腐熟的過程中產生的氨氣揮發不出去，很容易熏壞蔬菜。因此，出現熏苗現象時，應增加放風次數和時間，以便把棚內的氨氣及時排出棚外，避免氣害的發生。
   2.增施養根護根的肥料隨水沖施養根護根的功能性產品，既能夠降低未腐熟生物有機肥對根系造成的影響，同時像生物菌肥這樣的功能性肥料可抑制根部病害的侵染。